Building the future by doing more together

Newton C. Marcial Gomes

Newton C. Marcial Gomes

Investigador Auxiliar


  • Researcher ID: K-3211-2015
  • ORCID: 0000-0003-1934-0091
  • Departamento: Biologia
  • Grupo de Investigação: Ecologia Marinha e Estuarina
  • ISI Web of KnowledgeSM search factor: Author=(Gomes NCM) OR Author=(Gomes N) AND Address=(CESAM) NOT Author=(Gomes, Nuno)


Interesses de investigação

From ecology to biotechnology: combine ecology and biotechnology disciplines for a better understanding of the diversity, eco physiological functions and biotechnological potential of marine microbes.
Aquaculture microbiome modulation to improve food security and promote aquaculture sustainability.
Structural and functional studies of microbial communities in marine ecosystems, plants and animal hosts.
Development and validation of technologies for molecular diagnostics and DNA authentication.

Graus académicos

1995 - 1999. PhD in Microbiology. Institute of Microbiology Prof. Paulo de Góes. Federal University of Rio de Janeiro. Rio de Janeiro (Brazil).
1992 - 1995. MSc in Microbiology. Institute of Biological Sciences. Federal University of Minas Gerais. Belo Horizonte (Brazil).
1987 - 1992. Bachelor in Marine Biology. Integrated Faculties Maria Thereza, Niterói (Brazil).

Atividades científicas

04/2019 – Present. Assistant Researcher at the Centre for Environmental and Marine Studies (CESAM), Department of Biology, University of Aveiro, Portugal. (FCT/OE co-funded by FEDER/FNR, within PT2020 partnership agreement)

2009 - Present. Coordinator of the Laboratory for Molecular Studies of Marine Environments (LEMAM) of CESAM, University of Aveiro, Portugal.

2013 - 2018. Principal Researcher of CESAM and Department of Biology, University of Aveiro, Portugal. (FCT Investigator Programme 2012)

2007 -2013. Assistant Researcher of CESAM and Department of Biology, University of Aveiro, Portugal. (FCT — Ciência 2007)

2001 – 2007. Post-doctoral researcher. Federal Research Centre Julius Kühn-Institut (JKI), Germany.

1999 – 2000. Post-doctoral researcher. Federal Research Centre Julius Kühn-Institut (JKI), Germany.

Publicações

Projetos

Em curso (6) Concluído (19)
Symbioreactor - Sustainable Production of Bioactive Metabolites from Microbial Symbionts of Marine Sponges and Corals Ver mais

4D-REEF Past, present, and future of coral reefs in the Coral Triangle Ver mais

Sistema de língua bioelectrónica para a detecção de toxinas paralisantes marinhas em bivalves Ver mais

RhizoMiS - Manipulação do microbioma da rizosfera de Salicornia para exploração de bioprodutos e melhoramento de bioprocessos Ver mais

AquaHeal - Modulação microbiana em aquaculturas com sistema de recirculação: em direção de um sistema de produção supressor de doenças Ver mais

EcoTech-SPONGE- Estudo da ecologia, função e biotecnologia de plasmídeos originários de simbiontes microbianos em esponjas marinhas Ver mais

LínguaTox - Língua bioeletrónica para a deteção de toxinas marinhas em bivalves Ver mais

NO RESET - A metamorfose não apaga a história embrionária e larvar. Clarificação do papel do investimento maternal e dos regimes tróficos larvares no desempenho pós-assentamento de invertebrados marinhos costeiros Ver mais

Alterações na flora microbiana intestinal, na actividade de enzimas digestivas e na composição bioquímica de larvas de invertebrados marinhos num oceano em mudança à escala global (Nº E-116/10) Ver mais

STEP - Sistema de Tratamento integrado de Efluentes de Piscicultura Ver mais

SymbioCoRe - SYnergies through Merging BIOlogical and biogeochemical expertise in COral REsearch Ver mais

LTER-RAVE – Monitorização de longo prazo na Ria de Aveiro: rumo a um conhecimento mais fundo dos processos ecológicos, ambientais e económicos Ver mais

AQUASAFE - Desenvolvimento de novas tecnologias para antecipar e diagnosticar surtos de doenças na aquicultura Ver mais

RASTREMAR - Utilização de ferramentas moleculares na rastreabilidade de produtos alimentares de origem marinha Ver mais

Terapia fágica como alternativa de baixo impacto ambiental para inactivar bactérias patogénicas em pisciculturas Ver mais

LUSOEXTRACT -Descoberta de novos compostos naturais com propriedades terapêuticas isolados de Ecossistemas Portugueses únicos Ver mais

CARCACE - Colonização de carcaças de mamíferos no Oceano Atlântico profundo Ver mais

Mudança Climática Global e Poluição: uma combinação para o desastre? Ver mais

Desenvolvimento de métodos para acumulação de metais por bactérias endofíticas Ver mais

SWIMGLO – A ligação dos limites de placas Falhas Glória-SWIM e a sua importância na propagação da deformação tectónica e de ecossistemas profundos no limite de placas Açores-Gibraltar Ver mais

PORTONOVO- Qualidade de águas em portos / 2009-1/119 Ver mais

ARENA - Avaliação integrada de risco ecológico de nanomateriais em ecossistemas temperados e tropicais Ver mais

Processos de Remediação em Minas de Urânio e em outras áreas áreas mineiras Ver mais

CAPTAR-Ciência e Ambiente para Todos Ver mais

MicroMed - Desenvolvimento de um equipamento de medição do nível/grau de higienização e fúngico de produtos alimentares e de embalagem Ver mais

Orientações científicas

Em curso (6) Concluído (15)
PhD (Orientador Principal): Diogo Pinho (CESAM member)

PhD (Orientador Principal): Marina Ferreira (CESAM member)

Post-doc (Orientador Principal): Antonio Miguel de Oliveira Louvado (CESAM member)

Post-doc (Orientador Principal): Francisco José Riso da Costa Coelho (CESAM member)

Post-doc (Orientador Principal): Vanessa Jesus Oliveira (CESAM member)

Post-doc (Co-orientador): Ana Rita Moura Polónia (CESAM member)

PhD (Orientador Principal): Ana Cecília da Cruz Pires (ex-CESAM member)

PhD (Orientador Principal): Ana Cecília da Cruz Pires (ex-CESAM member)

PhD (Orientador Principal): Patrícia Tavares Martins (CESAM member)

PhD (Orientador Principal): Letícia Novaes Duarte (ex-CESAM member)

PhD (Orientador Principal): Camila Machado Boaventura -Bolsa Capes-Brasil (not a CESAM member)

PhD (Co-orientador): Rui Jorge Miranda Rocha (CESAM member)

PhD (Co-orientador): Vanessa Jesus Oliveira (CESAM member)

PhD (Co-orientador): Francisco José Riso da Costa Coelho (CESAM member)

PhD (Co-orientador): Antonio Miguel de Oliveira Louvado (CESAM member)

PhD (Co-orientador): Patrícia Maia Domingues (ex-CESAM member)

PhD (Co-orientador): Ana Catarina Bispo Prata (ex-CESAM member)

PhD (Co-orientador): Joana Catarina Moniz da Rocha (ex-CESAM member)

PhD (Co-orientador): Yolanda José Silva (ex-CESAM member)

Post-doc (Orientador Principal): Antonio Miguel de Oliveira Louvado (CESAM member)

Post-doc (Co-orientador): Catarina Marques (CESAM member)

Publicações em destaque

Cleary D.F.R., Swierts T., Coelho F.J.R.C., Polónia A.R.M., Huang Y.M., Ferreira M.R.S., Putchakarn S., Carvalheiro L., van der Ent E., Ueng J-P., Gomes N.C.M., de Voogd N.J. (2019) The sponge microbiome within the greater coral reef microbial metacommunity. Nature Communications. 10, 1644. (IF 12.35)   https://doi.org/10.1038/s41467-019-09537-8


Fernandez L., Louvado A., Esteves V.I., Gomes N.C.M., Almeida A., Cunha A. (2017) Biodegradation of 17 beta-estradiol by bacteria isolated from deep sea sediments in aerobic and anaerobic media. Journal of Hazardous Materials. 323, 359-366. (IF 6.75)   https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2016.05.029


Coelho F.J.R.C., Cleary D.F.R., Costa R., Ferreira M., Polonia A.R.M., Silva A.M.S., Simoes M.M.Q., Oliveira V., Gomes N.C.M. (2016) Multitaxon activity profiling reveals differential microbial response to reduced seawater pH and oil pollution. Molecular Ecology. 25, 4645-4659. (IF 6.08)   https://doi.org/10.1111/mec.13779


Coelho F.J.R.C., Cleary D.F.R., Rocha R.J.M., Calado R., Castanheira J.M., Rocha S.M., Silva A.M.S., Simões M.M.Q., Oliveira V., Lillebø A., Almeida A., Cunha Â., Lopes I., Ribeiro R., Moreira-Santos M., Marques C.R., Costa R., Pereira R. and Gomes N.C.M. (2015) Unraveling the interactive effects of climate change and oil contamination on laboratory simulated estuarine benthic communities. Global Change Biology. 5, 1871-1886. (IF 8.99)   https://doi.org/10.1111/gcb.12801


Polonia A.R.M., Cleary D.F.R., Freitas R., de Voogd N.J., Gomes N.C.M. (2015) The putative functional ecology and distribution of archaeal communities in sponges, sediment and seawater in a coral reef environment. Molecular Ecology. 24, 2, 409-423. (IF 6.08)      https://doi.org/10.1111/mec.13024


Oliveira V., Gomes N.C.M., Almeida A., Silva A.M.S., Simoes M.M.Q., Smalla K., Cunha A. (2014) Hydrocarbon contamination and plant species determine the phylogenetic and functional diversity of endophytic degrading bacteria. Molecular Ecology. 23, 6, 1392-1404. (IF 6.08)      https://doi.org/10.1111/mec.12559


Coelho F.J.R.C., Rocha R. J.M., Pires A.C.C., Ladeiro B., Castanheira J.M., Costa R., Almeida A., Cunha Â., Lillebø A.I., Ribeiro R., Pereira R., Lopes I., Marques C., Moreira-Santos M., Calado R., Cleary D.F.R., Gomes N.C.M. (2013) Development and validation of an experimental life support system for assessing the effects of global climate change and environmental contamination on estuarine and coastal marine benthic communities. Global Change Biology. 19, 8, 2584–2595. (IF 8.99)     https://doi.org/10.1111/gcb.12227

Patentes

Gomes, NCM, Oliveira, VJ, Coelho, FJRC, dos Santos, ARL. "Dispositivo portátil, método para leitura de etiquetas de autenticação e seus usos”. Pedido International:PCT/ IB2017/052570. Data do pedido: 28.04.2017. Número da Publicação: WO2017191575


Gomes NCM. “Molecular label containing dna molecules and process for marking and identifying the label”.  Pedido Internacional: PCT/PT2014/000056. Data do pedido: 22-09-2014. Número da Publicação: WO2015026254


Rocha, SM, Costa V, Ferreira J, Almeida A, Cunha A, Gomes NCM, Stein P, Petronilho S, Baptista I. "Equipment and flow extraction process of biological and chemical contaminants". Patente nacional (Portugal) n.º 105390. Concedida em 19/12/2017. Número da Publicaçãor: WO2012069888

Empreendedorismo Científico

Inovação e promoção do empreendedorismo em biotecnologia 


2017 – Presente - Membro da Rede de Mentores (Mentall®) da Unidade de Transferência de Tecnologia da Universidade de Aveiro (UATEC). A  MentAll®  é uma rede de mentoria criada pela  UATEC, que tem como principais  objetivos  apoiar  e consolidar iniciativas  empreendedoras,  encorajando  a  partilha  de  experiências,  know-how e competências entre empreendedores e mentores.


2016 - Present - Advisory Council Member of Broto Biotechnology Incubator. A bi-institutional incubator of State University of Santa Cruz (UESC) and State University of Feira de Santana (UEFS), Brazil. http://broto.uesc.br/


2016 - 2018 - Co-Fundador e promotor da DNA TRUSTAG uma empresa spin-off da Universidade de Aveiro. A empresa pretende fornecer produtos, serviços e soluções inovadores com objetivo de auxiliar as empresas a combater a proliferação de falsificações e a consequente desvalorização da sua propriedade intelectual. http://www.dnatrustag.com/


Julho 2017 - DNA TRUSTAG foi premiada com o Selo de Excelência da Comissão Europeia no âmbito do Programa Horizonte 2020 (Programa-Quadro Comunitário de Investigação & Inovação). A proposta da empresa alcançou a 3ª melhor pontuação em Portugal e o 9º lugar a nível Europeu no tópico “Engaging SMEs in security research and development” durante a fase 2 do Instrumento PME do Horizonte 2020 (H2020-SMEInst-2016-2017). 


Outubro 2016 - DNA TRUSTAG recebe financiamento na fase 1 do concurso "SME Instrument" (Horizonte 2020). Esse programa de financiamento da União Europeia, visa apoiar empresas com ideias disruptivas e soluções inovadoras que tenham impacto a nível europeu e global. https://uaonline.ua.pt/pub/detail.asp?lg=pt&c=48060


Julho 2016 - DNA TRUSTAG foi premiada com o Selo de Excelência da Comissão Europeia no âmbito do Programa Horizonte 2020 (Programa-Quadro Comunitário de Investigação & Inovação).


2012 – 2017 - Responsável pelo curso de sensibilização e capacitação em empreendedorismo “Microbiologia ambiental aplicada e bio-empreendedorismo”. Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC) (Bahia, Brasil). http://ppgbbm.uesc.br/

Serviços de avaliação de projetos

2019 - Expert evaluator for the European Commission, Horizon2020 frame work Programm (H2020) (Brussels, Belgium).


2018 - Expert evaluator in the field of microbiology and aquaculture for the European Commission, Horizon2020 frame work Programm (H2020) (Brussels, Belgium).


2016 - Reviewer for the Swiss National Science Foundation (SNSF), Div. Mathematics, Physical and Engineering Sciences (Berne, Switzerland).


2016 - Reviewer for the French National Research Agency (ANR). Call “Functioning of fluid and solid Earth" (Paris, France).


2015 – Reviewer for the National Council for Science, Higher Education and Technological Development (Zagreb, Croatia). Evaluation service for Establishing a Centre of Excellence in the Republic of Croatia.


2015 - Reviewer for the Swiss National Science Foundation (SNSF), Div. Mathematics, Physical and Engineering Sciences (Berne, Switzerland).


2015 - Reviewer for the International Foundation for Science (IFS) (Stockholm, Sweden).


2013 - Reviewer for the University of Puerto Rico's Sea Grant College Program (UPR Sea Grant) (Mayagüez, Puerto Rico).

Organização de reuniões científicas

Co-chair of the 15th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology (BAGECO 15). "Ecosystem drivers in a changing planet". Lisbon, Portugal. 26–30 May 2019. https://www.bageco.org/


Convenor and Chair of the session “Symbiosis (symbionts)” in the 17th International Symposium on Microbial Ecology (ISME17). Leipzig, Germany. 12 - 17 August 2018. https://isme17.isme-microbes.org/


Co-chair of the 1 st Advanced Seminars in Microbial Ecology Symbioses, biotechnology and industry in a changing climate. A workshop sponsored by the International Society for Microbial Ecology (ISME) Ambassador Programme at Higher Technical Institute of the Technical University of Lisbon, Lisbon (Portugal). December 16, 2016.


Organizer of the Mini-Workshop Project AquaSafe - Development of new technologies for early detection of outbreaks and rapid diagnosis of diseases in aquaculture. Department of Biology, University of Aveiro (Aveiro, Portugal). November 25, 2015. 


Member of the Organizing Committee of the “Jornadas da Ria de Aveiro 2011: Ciência e Tecnologia, Socioeconomia, Ordenamento e Gestão”. University of Aveiro (Aveiro, Portugal). May 2 – 4, 2011.

Prémios e Distinções

2015 - Universidade de Aveiro - 40 Anos 40 Inventores 40 empresários.
Em Setembro de 2015, a Universidade de Aveiro homenageou os inventores e os empreendedores que se destacaram ao longo das últimas quatro décadas de vida da Universidade de Aveiro (UA) através da publicação “40 anos, 40 inventores, 40 empreendedores”. Uma iniciativa conjunta da Unidade de Transferência de Tecnologia da Universidade de Aveiro (UATEC) e da Incubadora de Empresas da Universidade de Aveiro (IEUA). https://www.ua.pt/ReadObject.aspx?obj=39105


2014 - Protótipo premiado no I Concurso Transfronteiriço de Protótipos Orientados para o Mercado (Prototransfer). INESPO II - Programa Operacional de Cooperação Transfronteiriça Portugal-Espanha.


2014- PROVE IT- Prémio financeiro para o desenvolvimento do protótipo "Utilização de moléculas de ADN quiméricas para o desenvolvimento de etiquetas de código de barras moleculares". Unidade de Transferência de Tecnologia da Universidade de Aveiro (UATEC) e GAPI 3. Portugal.


2010 - Prémio BES Inovação na categoria de Economia Oceânica com o projecto "Fishcare".


2009 - 1º Prémio para a melhor ideia de negócio da Universidade de Aveiro apresentada no âmbito do Curso de Empreendedorismo de Base Tecnológica (CEBT09) como projecto "Fishcare".


Financiamento do CESAM: